Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp2Q9Z0Z3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp2Q9Z0Z3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp2Q9Z0Z3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp2Q9Z0Z3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Skp2Q9Z0Z3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skp2Q9Z0Z3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms