Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr1h3Q9Z0Y9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms