Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms