Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp2Q9Z0E6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 423 ms