Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pmfbp1Q9WVQ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms