Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacsin2Q9WVE8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacsin2Q9WVE8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacsin2Q9WVE8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacsin2Q9WVE8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pacsin2Q9WVE8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms