Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms