Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uchl5Q9WUP7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Uchl5Q9WUP7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uchl5Q9WUP7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uchl5Q9WUP7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uchl5Q9WUP7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uchl5Q9WUP7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uchl5Q9WUP7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl5Q9WUP7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl5Q9WUP7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms