Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim10Q9WUH5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim10Q9WUH5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms