Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcsQ9WU84 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcsQ9WU84 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms