Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scnn1bQ9WU38 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms