Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PplQ9R269 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PplQ9R269 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PplQ9R269 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PplQ9R269 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PplQ9R269 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PplQ9R269 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PplQ9R269 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PplQ9R269 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PplQ9R269 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PplQ9R269 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms