Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma1Q9R1P4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms