Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf25Q9QZR0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf25Q9QZR0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms