Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp21Q9QZL6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp21Q9QZL6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms