Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc4Q9QZD4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms