Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc39a1Q9QZ03 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc39a1Q9QZ03 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc39a1Q9QZ03 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc39a1Q9QZ03 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc39a1Q9QZ03 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc39a1Q9QZ03 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc39a1Q9QZ03 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc39a1Q9QZ03 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc39a1Q9QZ03 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc39a1Q9QZ03 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc39a1Q9QZ03 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc39a1Q9QZ03 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc39a1Q9QZ03 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc39a1Q9QZ03 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc39a1Q9QZ03 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc39a1Q9QZ03 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms