Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxnb3Q9QY40 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Plxnb3Q9QY40 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms