Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pcsk1nQ9QXV0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms