Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpsf3Q9QXK7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cpsf3Q9QXK7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms