Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH7

Neu3, Sialidase-3, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu3Q9JMH7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neu3Q9JMH7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neu3Q9JMH7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms