Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkain4Q9JMG4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms