Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ap3b2Q9JME5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms