Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rabgef1Q9JM13 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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