Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4apQ9JLV2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.5 ms