Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2l2Q9JLG4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms