Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SacsQ9JLC8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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