Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms