Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ldb3Q9JKS4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ldb3Q9JKS4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms