Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrac1Q9JKP8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms