Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trem3Q9JKE1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms