Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ybx3Q9JKB3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ybx3Q9JKB3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms