Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl3Q9JJR7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ascl3Q9JJR7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ascl3Q9JJR7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms