Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup50Q9JIH2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup50Q9JIH2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms