Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RabggtaQ9JHK4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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