Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcirg1Q9JHF5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms