Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn12Q9ER56 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn12Q9ER56 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms