Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a3bpQ9EQG9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms