Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
V1ra8Q9EQ48 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms