Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r46Q9EQ45 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms