Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clstn1Q9EPL2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms