Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sil1Q9EPK6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sil1Q9EPK6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms