Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r53Q9EP93 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r53Q9EP93 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r53Q9EP93 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r53Q9EP93 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r53Q9EP93 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r53Q9EP93 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms