Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP82

Wdr4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr4Q9EP82 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr4Q9EP82 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr4Q9EP82 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Wdr4Q9EP82 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms