Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc1Q9EP53 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsc1Q9EP53 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms