Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufa8Q9DCJ5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms