Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk1dQ9DC28 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk1dQ9DC28 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms