Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms