Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde1Q9DBZ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms