Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtr1Q9DBC3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms